质谱磷酸化是指利用质谱技术对蛋白质磷酸化进行分析。具体而言，首先要从生物样本（如细胞、组织等）中提取蛋白质，由于磷酸化蛋白质在样本中的相对丰度较低且磷酸基团容易丢失，往往需要特殊的富集方法（如免疫沉淀、化学亲和层析等）来获取磷酸化蛋白质或肽段。然后将这些样品进行离子化处理（如电喷雾离子化或基质辅助激光解吸 / 离子化），使蛋白质或肽段成为气态离子，进入质谱仪进行分析。质谱仪能够检测到由于磷酸基团的存在而导致的质量增加（例如磷酸基团的分子量约为 98Da，含有磷酸化修饰的肽段质量会相应增加），通过分析质谱数据（包括质荷比、碎片离子等信息）并与已知的蛋白质或肽段序列数据库进行比对，从而确定蛋白质的磷酸化位点、磷酸化程度等信息。质谱技术让我们能够以高精度、高灵敏度地分析复杂的生物分子，而磷酸化则是蛋白质在细胞信号传导和调控中扮演重要角色的修饰形式。因此，质谱磷酸化不仅可以帮助科学家揭示蛋白质的修饰状态，还能提供关于细胞信号通路的洞见。通过分析蛋白质的磷酸化状态，研究人员能够更深入地理解细胞的动态变化，这是因为磷酸化有助于调控蛋白质功能、蛋白质-蛋白质相互作用、以及蛋白质定位等方面。此外，许多疾病的发生发展与异常的蛋白质磷酸化有关。例如，在癌症研究中，通过质谱磷酸化分析，可以识别与癌症相关的异常磷酸化事件，从而为靶向治疗提供依据。在神经科学中，质谱磷酸化有助于理解神经元信号传导以及神经退行性疾病的分子机制。

一、质谱磷酸化技术流程

1、样品制备

样品的纯度和状态直接影响到后续的分析结果。通常，研究人员会选择合适的细胞或组织样本，通过裂解和提取蛋白质，再进行酶切处理。为了提高磷酸化肽段的富集效率，常采用金属氧化物亲和色谱（IMAC）或二硫键还原等预处理步骤。

2、质谱分析

常用的质谱技术包括液相色谱-串联质谱（LC-MS/MS），这种方法能够对样品中的复杂混合物进行有效分离和鉴定。通过质谱分析，可以精确测定蛋白质磷酸化位点和磷酸化模式。

3、数据分析

质谱产生的大量数据需要通过专门的软件进行解析。通常使用的分析软件包括MaxQuant、Proteome Discoverer等，通过这些工具，研究者可以对蛋白质的磷酸化进行定性和定量分析。数据的准确性和可靠性依赖于标准数据库的支持和良好的分析流程。

二、局限性

1、磷酸化位点定位的准确性

由于磷酸化蛋白质的复杂性和质谱数据解析的困难，仍然存在磷酸化位点定位不准确的情况。尤其是当蛋白质存在多个可能的磷酸化位点或者存在其他修饰同时发生时，准确判断磷酸化位点会变得更加复杂。

2、低丰度磷酸化蛋白的检测

在细胞内，一些磷酸化蛋白的含量极低，这给富集和检测带来了很大的困难。即使采用了富集方法，仍然可能会遗漏一些低丰度磷酸化蛋白，从而影响对整个磷酸化蛋白质组的全面了解。

质谱磷酸化在现代生物研究中的地位毋庸置疑。作为专业的生物质谱多组学优质服务商，百泰派克生物科技提供质谱磷酸化一站式服务。我们拥有经验丰富的团队和最前沿的技术平台，致力于为客户提供高质量的质谱磷酸化分析服务。如果您对质谱磷酸化技术感兴趣或有相关需求，欢迎与我们合作。

百泰派克生物科技特色项目

一、蛋白测序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析，提供基于质谱的蛋白测序分析服务，包括对蛋白质的氨基酸组成分析，N端测序，C端测序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质，提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务，对蛋白序列进行分析。

※服务优势：

1.采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可实现对所测定靶蛋白序列 100% 的覆盖;

3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;

4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;

5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug，即可完成检测;

6.测序不受N端封闭，PEC和和糖基化等N端修饰的影响。

二、蛋白质组学

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC，提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务，助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。

※服务优势：

1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析，发现新的生物标记物;

2.体内体外多种蛋白质标记方法，适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;

3.质谱分析灵敏度高，实验结果重复度高;

4.可检测较低丰度蛋白，线性范围广;

5.专业生物信息学分析，分析更系统准确。

三、单细胞质谱流式技术分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析，采用金属元素标记物（通常是金属元素标记的特异抗体）标记细胞表面和内部的分子，然后用流式细胞原理分离单个细胞，再用电感耦合等离子体质谱（ICP-MS）分析单个细胞的原子质量谱，最后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。

※服务优势：

1.技术先进，填补技术空白

采用金属标记抗体技术，避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标同时进行表征，百泰派克生物科技可做到同时检测51个目标蛋白。

2.分析数量大，成本较低

单细胞RNAseq受成本等因素限制，所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右，而流式质谱技术一次（单样本）就可分析至少10^5的细胞，实现了数量级的提高，且成本不高于单细胞RNAseq。

3.应用前景大

①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化，在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景；

②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外，质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰；

③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现

百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析，可从最小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究，旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案，深入挖掘未知的靶标。

五、生物药物表征

百泰派克基于高分辨率质谱技术，MALDI TOF，高效色谱分离技术，提供一系列完善的生物药物分析方案，从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析，到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务，帮助生物医药生产商提高生物药物品质。

百泰派克生物科技七大检测平台

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物质谱多组学优质服务商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等专业服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则，通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证，建立了完备的质量体系，数据冷热/异地备份，设备定期计量/期间核查，软件审计追踪，为客户提供一体化解决方案和技术服务，支持新药研发、药物申报注册和生产放行。

1.公司采用ISO9001质量控制体系，专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务；

2.获国家CNAS实验室认可，为客户提供符合全球药政法规的药物质量研究服务；

3.业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等；

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